Las glándulas salivales están bajo el control del sistema nervioso parasimpático. La estimulación del sistema nervioso parasimpático puede producir una secreción excesiva de saliva; así,  la reacción adversa a algunos fármacos como tranquilizantes, anticonvulsivos, etc. pueden agravar el  babeo. De la misma forma, el tratamiento con drogas anticolinergicas pueden reducir la secreción de saliva y consecuentemente facilitar el establecimiento del control del babeo. Existen estudios en los que se demuestra que el tratamiento con anticolinergicos reduce la secreción de saliva alrededor de un 50%.

El problema de los tratamientos farmacológicos son sus efectos secundarios. En este sentido, se describen como efecto de los mismos, un incrementeo de la vaso-dilatación, inhibición de las contracciones gastro-intestinales, reducción de la secreción de las glándulas bronquiales, gástricas, etc., dilatación de las pupilas (midriasis), parálisis de acomodación, etc. Estos efectos secundarios hacen que se deba valorar muy bien cuando se debe prescribir este tratamiento y cuando no. Es adecuada una intervención híbrida, fármaco-psicológica, en la que se aprovecha  la disminución temporal de la secreción salival para introducir los programas de modificación de conducta.